Le microbiote intestinal c’est l’ensemble des micro-organismes (bactéries, champignons, virus) qui sont des symbiotes qui cohabitent avec nous, vivant dans nos intestins. Cette présence massive (on parle même de 1,5 kg !) ne nous est pas nocive, bien au contraire : c’est un exemple de mutualismeoù les deux parties bénéficient d’une interdépendance mutuelle. En effet, ces micro-organismes remplissent des fonctions essentielles à notre santé, de la digestion à notre humeur. Cet équilibre complexe commence à se former dès la naissance et se développe au travers d’interactions avec l’environnement comme l’alimentation, nous rappelant que, écologiquement, nous ne sommes pas des individus isolés mais faisons partie d’un système à la fois microscopique et immense.
Le microbiote intestinal est l’ensemble des micro-organismes présents dans notre intestin
Commençons par un peu de clarté : microbiote et microbiome ne sont pas synonymes. Lorsque nous utilisons le terme microbiote, nous faisons référence à l’ensemble des micro-organismes vivants, tandis que lorsque nous parlons de microbiome, nous faisons référence à l’ensemble du matériel génétique contenu dans ces organismes. Le microbiote intestinal est constitué non seulement d’un bactériotec’est-à-dire l’ensemble des bactéries réelles qui résident dans notre intestin, mais aussi par une virote et une mycote, respectivement constituées de virus et de champignons résidant dans l’intestin. Le terme flore bactérienne au lieu de cela, bien que ce ne soit pas tout à fait incorrect, il fait référence à une classification datée des bactéries, qui les incluait encore parmi les plantes et, en général, il serait préférable d’utiliser le terme microbiote.
À l’âge adulte et pendant la majeure partie de la vie, il pèse jusqu’à un kilo et demi de notre poids corporel et est composé de deux parties : un stablequi représente environ 40% de l’espèce et joue des rôles fondamentaux et difficiles à remplacer, e une variablequi représente les 60 % restants, remplit des fonctions secondaires et est davantage influencé par l’alimentation et les habitudes. L’équilibre délicat qui équilibre les fonctions et l’abondance des espèces microbiennes sera à nouveau modifié vers âge tardifentraînant de fait des risques plus élevés de pathologies intestinales.
Comment naît le microbiote et comment il arrive dans notre intestin
Après avoir établi l’importance de la terminologie, entrons dans le vif du sujet en abordant une question fondamentale : comment ces bactéries pénètrent-elles dans notre tube digestif? Initialement, on croyait que pendant la phase néonatale, l’être humain était essentiellement stérile et que, par conséquent, la contamination nécessaire à l’obtention d’un microbiote intestinal s’est produite au moment de la naissance et dans les premiers instants ultérieurs, comme l’allaitement. Aujourd’hui, la stérilité néonatale est moins considérée comme acquise, grâce à de nouvelles études suggérant la présence de bactéries maternelles chez les fœtus : il n’existe actuellement pas de large consensus scientifique concernant la stérilité prénatale.
Il reste cependant certain que le passage du canal vaginal maternel et allaitement sont des moments cruciaux pour la formation du microbiote de l’enfant à naître. Même moi né par césarienneet donc non exposé à une contamination maternelle via le vagin, semble-t-il exposé à un risque plus élevé contracter des maladies intestinales et des allergies. Immédiatement après la naissance, notre microbiote intestinal est encore dans une phase de grands changements et de maturation, et est donc particulièrement sensible aux régime et exposition environnementale.
Ses fonctions et son impact sur la santé
Grâce à séquençage génétiquel’étude du microbiome permet d’identifier les espèces présentes dans le microbiote et d’analyser des aspects fondamentaux, tels que la diversité des espèces, leur abondance relative et la relation entre les espèces bénéfiques et potentiellement nuisibles. Cependant, il est important de comprendre que le microbiote n’agit pas indépendamment de notre organisme : ses propriétés dérivent deinteraction entre les produits bactériens et le métabolisme humain. Par conséquent, il n’est pas possible de déterminer si une espèce est bénéfique ou non sans tenir compte de facteurs tels que son abondance, sa localisation et l’état de santé de l’hôte.
L’analyse de la population microbienne de notre intestin a révélé que les bactéries intestinales les plus répandues et les plus importantes dans l’ensemble de la population mondiale appartiennent au genre de Bacteroides, Prevotella et Ruminococcus. La diversité des espèces de notre microbiote intestinal remplit un certain nombre de fonctions, parmi lesquelles certains sont indispensables pour notre survie.
Parmi les plus importants, nous trouvons le production de vitamines comme le K et le B12, la synthèse des acides aminés et des acides gras à chaîne courte et le contrôle de la prolifération cellulaire. De plus, certaines bactéries semblent maintenir le corps en forme. système immunitaire pour identifier les cellules anormales ou étrangères et les éliminer. Le microbiote assure alors des fonctions protectrices, grâce à la capacité de combattre les infections de micro-organismes nocifs pour eux-mêmes et pour nous qui les hébergeons.
Cependant, les effets du microbiote intestinal s’étendent au-delà de l’intestin, influençant des organes et des systèmes tels que le foie, le système nerveux, le système cardiovasculaire e le système endocrinien-métabolique. Le microbiote peut influencer le foie grâce à des substances absorbées depuis l’intestin, qui en cas de déséquilibre peuvent provoquer une stéatose ou une inflammation. Nous enquêtons récemment la relation entre le microbiote intestinal et le système nerveux central. Nous découvrons que le microbiote est capable d’influencer le tonus dehumour et certains comportements : sans surprise, on entend souvent parler de l’intestin comme du « deuxième cerveau ».
Enfin, le microbiote peut contribuer au contrôle de facteurs de risque cardiovasculaire comme l’hyperlipidémie, le diabète de type 2 et l’athérosclérose, il est également capable de modifier les résultats des thérapies pour des pathologies telles que la dépression et le cancer, s’affirmant ainsi comme un élément de premier intérêt en médecine, même dans des champs apparemment lointains de la santé humaine.