A l’intérieur du corps d’Ötzi, le célèbre Maman Similaunles dieux ont été identifiés et isolés levures toujours en vie après plus 5 000 ans. L’« homme des glaces » est la momie naturelle la plus ancienne et la mieux conservée d’Europe, datant d’environ 3300 avant JC. Nous savons que cet homme d’environ 45 ans a perdu la vie à la suite d’une violente attaque et qu’à partir de ce moment il est resté coincé dans les glaces alpines jusqu’à sa découverte, survenue accidentellement à 1991 sur le glacier du Similaun dans le Haut-Adige. Les basses températures n’ont pas seulement ralenti la décomposition de son corps, elles ont également conservé des traces du micro-organismes qui l’accompagnait. Aujourd’hui, une nouvelle étude publiée dans la revue Microbiote analysé ce patrimoine biologique caché grâce à des techniques avancées de séquençage de l’ADN et des cultures microbiologiques. Les chercheurs ont identifié bactéries attribuable à l’ancien microbiome intestinal d’Ötzi et à plusieurs levures parfaitement adaptées aux environnements froids.
La véritable surprise est venue lorsque quatre de ces levures ont été isolées et cultivées en laboratoire : les tests ont montré qu’elles étaient encore viable au moment de l’échantillonnage. Les analyses ont indiqué que certaines espèces adaptées au froid ils ont peut-être continué à persister notamment les conditions de stockage.
Comment sont identifiées les levures encore viables ? Ötzi
La momie Ötzi est conservée à Musée archéologique du Tyrol du Sud dans une pièce à -6 °C et avec 99% d’humidité, des paramètres qui rappellent ceux du glacier dont il est issu en 1991. Pour la plupart des micro-organismes, il s’agit d’un environnement défavorable. Reste cependant à comprendre comment réagissent les espèces qui, au contraire, sont habituées à vivre au froid. L’étude deInstitut d’études sur les momies est né précisément de cette question et étudie quels micro-organismes sont présents sur la momie et si certains d’entre eux peuvent encore être viables.
Pour répondre à la question, l’équipe a analysé des échantillons de nombreuses parties du corps d’Ötzi, de l’eau obtenue lors du dégel contrôlé de la momie, de la glace superficielle, du sol du lieu de découverte et même de l’air des environnements muséaux. Les chercheurs ont utilisé différentes techniques complémentaires. Certains permettent d’identifier l’ADN des micro-organismes présents, d’autres permettent de les cultiver en laboratoire pour vérifier s’ils sont encore viables. Grâce à cette approche, il a été possible de distinguer des microbes anciens, des organismes et des espèces introduits plus récemment provenant de l’environnement glaciaire d’origine.
Le microbiome de la momie Similaun : je bactéries intestin ancien
L’une des principales difficultés consistait à déterminer si ces micro-organismes étaient présents depuis des milliers d’années ou s’ils étaient arrivés récemment. Pour ce faire, les scientifiques ont étudié les dommages accumulés dans l’ADN au fil du temps. Un ADN très ancien présente en effet altérations chimiques caractéristiques qui s’accumulent après des siècles ou des millénaires. Dans le bactéries d’anciennes traces intestinales, ces traces résultaient particulièrement évidentavec des niveaux qui dans certains cas dépassaient 10 % et atteignaient jusqu’à 20 %. Au contraire, certaines des levures isolées ont montré des quantités beaucoup plus faibles de ces dégâts, suggérant une histoire et une histoire différentes. le plus récent.
Dans les échantillons prélevés à l’intérieur de la momie, plusieurs bactéries normalement associées àintestin humain. Certaines d’entre elles sont particulièrement intéressantes car elles sont aujourd’hui plus souvent observées dans les populations traditionnelles et résultent moins courant dans les sociétés industrialisées. Parmi les micro-organismes identifiés figurent Romboutsia hominis, Ruminococcus bromii, Treponema succinifaciens, Kineothrix, une grande quantité de bactéries appartenant au genre Clostridies et d’autres bactéries typiques de l’environnement intestinal. Selon les auteurs, l’intestin d’Ötzi représente une sorte de capsule temporelle microbiologique qui conserve encore la signature biologique d’une communauté humaine ayant vécu à l’âge du cuivre.
La découverte la plus surprenante : des levures toujours actives chez l’Iceman
La partie la plus inattendue de l’étude concerne cependant certains levuresmicro-organismes appartenant au règne des champignons. À partir des échantillons prélevés sur la peau et sur l’eau présente à l’intérieur de la momie, les chercheurs ont réussi à isoler quatre espèces différentes : Glaciozyma watsonii, Mrakia robertii, Phenoliferia glacialis et un genre de ça Goffeauzyma. Ces organismes ne sont pas des contaminants courants provenant de l’environnement domestique ou des aliments. Les analyses génomiques montrent qu’ils sont étroitement liés avec des levures qui vivent dans des environnements extrêmement froidscomme les régions de l’Arctique et de l’Antarctique et les glaciers de haute altitude.
Pour voir si la composition des levures avait changé au fil du temps, les chercheurs ont comparé deux échantillons de peau prélevés en 2010 et 2019. La différence la plus évidente concerne Glaciozymeune levure typique des milieux froids. Dans l’échantillon de 2010, elle représentait environ 85 % des levures identifiées, tandis que dans l’échantillon de 2019 son abondance relative s’était élevée à 98 %.
Les chercheurs ont également observé d’autres différences. Dans les échantillons les plus récents, l’ADN attribué à Glaciozyme a montré des fragments d’ADN en moyenne plus longtemps et moins de modifications. Selon les auteurs, ces résultats indiquent que la communauté de levures associée à la momie n’est pas resté inchangé au fil du temps. Certaines espèces possèdent également des gènes liés à la production d’enzymes capable de dégrader diverses substances biologiquescomme le cuir ou les tissus. Ces données à elles seules ne démontrent pas que de tels processus de dégradation ont déjà lieu sur la momie, mais elles aident à comprendre les capacités biologiques potentielles de ces organismes. Et cela, comme l’a déclaré le Dr Maixner, co-auteur de l’étude, au journal El Paìs, « cela pourrait représenter un danger latent pour l’intégrité de la momie à long terme ».
Cependant, la recherche laisse une question ouverte : ces levures sont-elles restées actives tout le temps, même très lentement, ou ont-elles traversé de longues périodes d’activité ? tranquillité et ont-ils été réactivés au moment de la collecte ? Les analyses réalisées jusqu’à présent ne permettent pas de choisir avec certitude entre les deux possibilités.